建兰种质资源遗传多样性分析及核心种质构建

• 作者: 陈明堃 陈璐 孙维红 马山虎 兰思仁 彭东辉 刘仲健 艾叶
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 建兰 种质资源 表型性状 SSR 遗传多样性 核心种质
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告|Research Notes
• 页码范围: 175-186
• 页数: 12页
• 分类号: S682.31
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2021-0312

摘要

研究记录了311份建兰(Cymbidium ensifolium)种质资源的萼片、花瓣、唇瓣颜色以及叶艺、瓣型和唇瓣斑点等质量性状的表型特征,并对其进行赋值和统计分析;利用22对SSR荧光引物对311份建兰种质资源进行PCR扩增,分析其遗传多样性;利用Structure软件分析建兰种质资源的群体结构,采用主成分分析和聚类分析进行验证;运用Core Finder软件和t检验分析并筛选核心种质.结果 表明:311份建兰种质资源的6个质量性状的表型遗传多样性均大于0.5,表明建兰种质资源的表型具有丰富的遗传变异;22对SSR荧光引物共检测到171个等位基因(Na),平均有效等位基因数(Ne)为2.729,Shannon's信息指数(Ⅰ)为1.026,表明建兰种质资源具有丰富的遗传多样性;Structure软件分析结果显示最优的群体数K值为3,群体间有少量种质混杂;群体结构分析将建兰种质资源分为3个类群,主成分分析和聚类分析进一步验证了其分类的可靠性.本研究中构建的建兰核心种质51份占原有种质资源的16.4％,等位基因数(Na)保留率为100％,有效等位基因数(Ne)保留率为130％,Shannon's信息指数(Ⅰ)保留率为124％.通过f检验和主坐标分析发现,核心种质与原有种质的遗传多样性无显著差异,说明构建的51份核心种质能最大程度代表建兰种质资源的遗传多样性.