本发明公开了L‑鼠李树胶糖‑1‑磷酸醛缩酶及其在催化合成稀有糖D‑阿洛酮糖中的应用,其基因序列为由SEQ ID NO.1编码的野生型L‑鼠李树胶糖‑1‑磷酸醛缩酶分别经过其氨基酸第29、188、266或152位饱和定点突变。本发明克服了野生型RhaD产生D‑阿洛酮糖:D‑山梨糖=1:1没有立体选择性的缺陷,使得催化反应仅产生D‑阿洛酮糖或以D‑阿洛酮糖为主,且经过突变的RhaD的酶活较高。本发明方法制备的定点突变的RhaD制备D‑阿洛酮糖,合成效率高、工艺简单、节约成本、D‑阿洛酮糖催化效率最高达到100%,利用本发明方法实现了工业化RhaD催化D‑甘油醛大量合成D‑阿洛酮糖。