摘要:

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目的:探讨人类APOBEC3七个蛋白结构与功能的相似与不同之处,为进一步深入研究APOBEC3的功能和抗病毒药物的开发提供参考.方法:采用生物信息学方法对APOBEC3的七个蛋白进行了理化性质、亚细胞定位、跨膜结构及相互作用蛋白的预测分析.结果:发现人类APOBEC3均为亲水性的非跨膜蛋白,除APOBEC3H主要定位于细胞核,其余APOBEC3蛋白主要定位于细胞质;APOBEC3的二级结构非常相似,只有APOBEC3Fα螺旋所占比例最高,其余APOBEC3以无规则卷曲所占比例最高;APOBEC3DE、APOBEC3F可能还参与了细胞色素C的电子传递;APOBEC3A、APOBEC3B、APOBEC3C参与DNA修饰过程,A3H参与DNA去甲基化过程,提示APOBEC3A、APOBEC3B、APOBEC3C和APOBEC3H可能参与基因突变,导致基因组的不稳定与癌症等疾病发生;APOBEC3G参与病毒的防御应答,提示APOBEC3G具有广谱抗病毒功能.结论:人类APOBEC3是具有脱氨酶活性和水解酶活性的保守蛋白家族,可参与多种生物过程,生物学功能比较复杂.

摘要:

与APOBEC3s其他成员相比,APOBEC3C是特殊的,因为APOBEC3C的抗病毒和抗逆转录元件的功能较弱.APOBEC3C只有一个与锌离子协调的胞嘧啶脱氨酶域,并根据氨基酸特异性被划分为A3Z2.与APOBEC3G相比,APOBEC3C引发HIV-1DNA上胞嘧啶脱氨基的数目较少,所以降低了其抑制HIV-1逆转录及整合的能力.APOBEC3C可在靶细胞引起G→A突变,而G→A突变能导致病毒多样性却无法抑制病毒复制.人类APOBEC3C编码的S188I多态性增强了蛋白质的酶促活性及其抑制HIV-1的能力.另外,人类APOEC3C酶的二聚化增加了单链DNA的持续合成能力,可导致体外和细胞内逆转录过程中的大量突变.APOBEC3C已在灵长类的正选择下进化,是病毒在天然感染过程中必须对抗的重要屏障.因此,对APOBEC3C的研究可为抗病毒和抗癌症的治疗设计提供一些思路.

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目的 探讨APOBEC3基因多态性与汉族女性乳腺癌易感性的关联性.方法 应用PCR-限制性多态性内切酶技术检测282例乳腺癌患者和302例体检者的APOBEC3A基因单核苷酸多态性(SNP)位点:rs5757402、rs17370615和rs12157810,以及APOBEC3B基因的拷贝数变异(CNV)位点.结果 rs17370615和CNV位点的等位基因频率分布在两组间比较差异有统计学意义(P＜0.05),rs17370615位点的GA基因型、CNV位点Ins/Del和Del/Del基因型的频率分布在两组间比较差异有统计学意义(P＜0.05),风险值分别为1.457(1.116,1.902),2.927(1.478,5.796)和1.629(1.156,2.297).结论 APOBEC3基因的rs17370615和CNV位点的多态性与乳腺癌的发病风险存在关联.