摘要:

采用PCR-SSCP及克隆测序技术对大白、长白、杜洛克共210头仔猪SLA-DQA基因第4外显子进行多态性检测,以探讨猪SLA-DQA基因的遗传特性.结果显示:共获得4种等位基因(A、B、C、D),6种基因型(AA、AB、CC、CD、BB、BC).6种基因型在杜洛克猪中都被检测到,而在大白猪中只检测到AA、AB、CC 3种基因型,在长白猪中未检测到BC基因型.A等位基因和AA基因型的频率在3个群体中最高,为优势基因和优势基因型.对不同SSCP带型的对应片段进行测序分析,共发现3个核苷酸突变位点(5126bp A→G,5158bp A→T,5233bp G→A),其中,5126bp处A→G导致氨基酸由异亮氨酸变为缬氨酸.经x2适合性检验,3个猪品种在此位点上都偏离了Hardy-Weinberg平衡状态(P＜0.05).群体遗传学分析发现:长白猪、大白猪多态信息含量(PIC)分别为0.3233,0.4548,属于中度多态(0.25＜PIC＜0.5),杜洛克为0.6101,属于高度多态(PIC＞0.5)；各基因型在三品种中的分布差异显著.研究结果证实,猪SLA-DQA基因第4外显子具有丰富的遗传多态性.

摘要:

采用克隆测序的方法对八眉猪DQA基因编码区进行多态性分析，并利用生物信息学方法预测八眉猪DQA基因的理化特性及其编码产物的结构功能。结果显示：八眉猪DQA基因编码255个氨基酸，编码区序列有14个碱基变异，11个氨基酸变异，外显子2区域表现出丰富的多态性。 DQA基因编码产物是一种不稳定的水溶性蛋白，二级结构为混合型，三级结构由α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲组成。蛋白质功能预测结果显示，信号转导、受体、胁迫应答、免疫应答和生长因子的几率较高。研究结果为八眉猪的抗病分子育种和经济性状相关基因筛选提供理论依据。

摘要:

为了探明黑线仓鼠MHC的结构与功能并寻找分子标记,对MHCⅡ类DQA基因的外显子2进行克隆和序列分析.提取黑线仓鼠3个群体(吴村、沂南和临朐)的基因组DNA构建基因池,利用PCR技术扩增得到249 bp的片段,将该目的片段连接到pMD18-T载体中,重组质粒转入大肠杆菌DH5a后利用蓝白斑法筛选阳性克隆,测序后得到该目的片段的核苷酸序列(Genbank登录号:FJ209306)并推导出氨基酸序列.结果表明:黑线仓鼠、人类、大鼠、小鼠、猪、马、牛、兔之间DQA基因外显子2的核苷酸序列同源性为68.7%-85%,氨基酸序列同源性为56.8%-83.5%,黑线仓鼠与大鼠、小鼠亲缘关系更近.测序得到的DQA基因外显子2的序列在物种间具有丰富的多态性,可以作为物种遗传分析的分子标记.

摘要:

主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)是脊椎动物重要的功能基因家族之一,其所编码的MHC分子具有维持机体世代适应环境变化的能力和功能,是研究动物适应性进化研究的最佳遗传标记.本研究选择青藏高原的主要畜种资源——藏绵羊(Ovis aries)为研究对象,利用聚合酶链式反应-单链构象多态(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)技术对甘肃(欧拉,乔科和甘加型)和青海(青海欧拉型和青海高原型)的5个藏绵羊生态群体的DQA座位基因遗传特征进行研究,以期揭示其与藏绵羊高原适应性进化的机制;结果在藏绵羊DQA座位的2个基因中发现了33个等位基因和125个核苷酸变异位点,表明5个生态群体藏绵羊的DQA座位基因均具有丰富的多态性;分析证明平衡选择是维持藏绵羊DQA座位基因多态性的主要机制之一,甘肃和青海5个藏绵羊生态群体DQA座位基因区域之间的变化(among groups)小于同一区域不同群体间的变化(among population with groups),进一步说明藏绵羊DQA座位基因发生了正选择作用和适应性进化.研究结果将为藏绵羊的遗传改良和种质创新提供基础数据.