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中国幽门螺杆菌vacA基因的等位变异
中国幽门螺杆菌vacA基因的等位变异
作者:
Cristina Pagliaccia
Daniela Burroni
Jean-Marc Reyrat
John L.Telford
Rino Rappuoli
丁华
屠振兴
杜奕奇
纪徐淮
许国铭
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
幽门螺杆菌
vacA基因
基因序列分析
摘要:
目的明确中国幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)全长vacA基因的等位变异及其与西方主要菌株基因序列的差异。方法从5例胃病患者胃黏膜活检组织中分离培养22个单个Hp克隆,以Western blot确定vacA表型特点,以体外细胞毒性试验确定其活性。然后选择5株有代表性的克隆进行基因组DNA抽提、PCR扩增及vacA基因全序列测定、分析。结果 5株中4株vacA表达阳性。只有1株(5060d)可在体外诱导HeLa细胞产生显著空泡变性。5株vacA基因有相同的信号序列(sla)及相似的编码相对分子质量为37×103和跨膜输出段(outermembrane exporter,OME)的基因序列。4株vacA基因的中间区(编码相对分子质量为58×103蛋白)表现为m2型等位基因,1株为m1型。同型中国Hp vacA基因相似率为97.6%~99.2%,高于西方同型相似率(92.1%)。结论中国人Hp vacA基因与西方菌株相比存在显著的等位变异,形成相对独立的一个亚簇。m2型菌株比m1型菌株常见。细胞毒活性与vacA基因中间区类型有关,而与信号序列无关。
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文献信息
篇名
中国幽门螺杆菌vacA基因的等位变异
来源期刊
中华消化杂志
学科
医学
关键词
幽门螺杆菌
vacA基因
基因序列分析
年,卷(期)
2000,(3)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
151-154
页数
4页
分类号
R4
字数
2437字
语种
中文
DOI
10.3760/j.issn:0254-1432.2000.03.002
五维指标
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vacA基因
基因序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中华消化杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0254-1432
CN:
31-1367/R
开本:
16开
出版地:
上海市北京西路1623号
邮发代号:
4-291
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
6863
总下载数(次)
10
总被引数(次)
77736
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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