居群遗传结构研究中显性标记数据分析方法初探

• 作者: 葛颂 钱韦
• 来源期刊: 遗传学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 显性标记 居群遗传结构 疣粒野生稻 RAPD Hardy朩einberg平衡
• 年，卷（期）: 2001,（3）
• 页码范围: 244-255
• 页数: 12页
• 分类号: Q346.1
• 字数: 8864字
• 语种: 中文

摘要

为对比显性标记应用于居群遗传结构研究时不同统计参数的适用性，利用RAPD技术对中国5个居群的100个疣粒野生稻个体进行了遗传结构分析。在衡量居群遗传多样性水平时，多态位点比率（PPB）会低估遗传变异的量，其价值不如Shannon多样性指数和Nei基因多样性指数，而采用Nei指数时不必进行Lynch-Milligan矫正。对个体间遗传关系进行分析时，17种遗传相似性指数矩阵两两之间的Mantel检测都表现出极显著的相关性（r＞0.95,t＞t0.01),且UPGMA聚类图的模式基本相似。基于统计量（st）的分子方差分析（AMOVA）和基于Hardy-Weinberg平衡假设的Nei遗传距离分析结果具有显著相关性，它们都适合用于遗传结构分析，且应用后者时应通过Lynch-Milligan矫正减少显性遗传对变异估计偏低的影响，增加检测居群间遗传分化的能力。此外，AMOVA分析、Gst分析和Shannon多样性指数巢式分析都得出一致的结果，表明疣粒野生稻的遗传变异绝大部分存在于地区之间，而地区内和居群内的多样性程度较低。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	葛颂	中国科学院植物研究所系统与进化植物学开放研究实验室	27	1623	19.0	27.0
2	钱韦	中国科学院植物研究所系统与进化植物学开放研究实验室	14	328	6.0	14.0