尖吻蝮蛇毒酸性磷脂酶A2的新晶型结构

• 作者: 周元聪 宋时英 张海龙 林政炯 谷立川
• 来源期刊: 生物化学与生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 磷脂酶A2 X射线晶体学 三维结构 溶血活性 界面催化
• 年，卷（期）: 2002,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 266-272
• 页数: 7页
• 分类号: Q5
• 语种: 英文

摘要

从尖吻蝮蛇毒中分离出一种酸性磷脂酶A2, 得到了一种新的晶型. 用分子置换法测定其晶体结构, 结构的分辨率达到0.28 nm. 该结构给出21.9%的晶体学R因子 (R-free=25.7%)和合理的立体化学参数. 与已报道的晶型相似, 不对称单元的两个独立分子形成二体, 揭示了这种二体的稳定性. 二体的形成过程也伴随着14～23肽段显著的构象变化, 这一肽段属于磷脂酶A2的界面识别部位. 氨基酸序列分析表明, 带正电荷的34位残基是所有第二类具有溶血活性磷脂酶A2的共同特点. NaCl对晶体的堆积具有显著的影响, 从而导致晶胞参数的明显改变. 与已报道的晶型不同, 在酶分子的疏水通道内观测到了2-甲基-2,4戊二醇(2-methyl-2,4-pentanediol, MPD)分子.