水稻S5区候选克隆R2I19的筛选及序列信息学分析

• 作者: 刘兵 刘良式 易厚富 王宏斌 王金发 范云
• 来源期刊: 中山大学学报(自然科学版)
• 学科: 生物学
• 关键词: 水稻Oryza sativa L. cosmid文库 广亲和基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2002,（6）
• 页码范围: 78-82
• 页数: 5页
• 分类号: Q751
• 字数: 3966字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0529-6579.2002.06.022

摘要

以水稻广亲和品种Cpslo17为材料,构建了一个覆盖9倍核基因组的cosmid文库,其平均插入片段约40 kb.以与广亲和位点紧密联锁的单拷贝分子标记BAC23D12的R末端为探针,从cosmid文库中筛选得到一个阳性克隆R2I19(～32 kb).结合S5位点的高密度连锁图和物理图谱,初步确定为S5区候选克隆.对该克隆的2个TAC亚克隆TRW1510(～15 kb)及TRW1517(～15 kb)进行了初步的生物信息学分析,证实与已知的水稻基因组序列有很高的同源性,并显示其中可能含有与水稻育性相关的基因.