根肿病菌核糖体基因ITS区段的克隆测序及其在检测中的应用

• 作者: 曾莉 李家瑞 杨佩文 杨勤忠 王群
• 来源期刊: 云南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 十字花科蔬菜根肿病菌 ITS(Internal transcribed spacer)区段 基因克隆和测序 基因检测
• 年，卷（期）: 2003,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 228-233
• 页数: 6页
• 分类号: S332.2|S436.341.1
• 字数: 3584字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-390X.2003.03.003

摘要

应用真菌核糖体基因ITS区段通用引物ITS1和ITS4,对十字花科蔬菜根肿病菌(Plasmodiophora brassicae)rDNA进行PCR扩增,并将扩增到的目的片段克隆到pGEM-T载体上.对重组克隆进行测序和碱基编码结构特点分析,结果表明:十字花科蔬菜根肿病菌ITS1区长141bp,5.8S区长160bp,ITS2区长187bp,rDNA总长为488bp. 根据此序列设计一对根肿病菌特异性寡聚核苷酸引物(前引物:5'AGG TGA ACC TGC GGA AGG AT 3'和后引物:5'TTC AGC GGG TAA TCC TAC CT 3'),应用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)技术,对分离自十字花科蔬菜(白菜、青菜、甘蓝、芥蓝、花椰菜等)根肿病菌全基因组DNA进行特异性扩增试验.试验结果表明,该对引物能从十字花科根肿病菌全基因组DNA中扩增到约500bp长度的分子片段,而对照菌株和健康对照则无扩增产物.该实验结果对有效追踪根肿病菌在田间的发生动态监测和预测预报提供了重要的信息和手段.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾莉	云南省农业科学院植物保护研究所	33	426	11.0	20.0
2	李家瑞	云南省农业科学院植物保护研究所	23	491	11.0	22.0
3	杨佩文	云南省农业科学院植物保护研究所	41	585	12.0	23.0
4	杨勤忠	云南省农业科学院植物保护研究所	15	582	9.0	15.0
5	王群	云南省农业科学院植物保护研究所	13	344	8.0	13.0