SEN病毒中国分离株基因克隆及序列分析

• 作者: 孟庆华 李娅 杜娟 王全立 王海平 詹林盛
• 来源期刊: 军事医学科学院院刊
• 学科: 医学
• 关键词: 基因组,病毒 非甲-非戊型肝炎 SEN病毒 聚合酶链反应 序列分析
• 年，卷（期）: 2003,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 419-421,431
• 页数: 4页
• 分类号: R512.6
• 字数: 2540字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-9960.2003.06.007

摘要

目的:测定SENV-D亚型中国分离株的基因组序列,并对其进行初步分析.方法:根据国外已发表的SEN病毒基因序列设计特异性引物,应用套式PCR方法从一份非甲-非戊型(non-A-E)肝炎患者血清中,分段扩增了包括SENV-D型所有编码区(ORFs)长3175bp的DNA片段,将其克隆到T载体后测序.结果:测序结果经BLAST软件分析,与国外发表的3株D型SEN病毒SENV-D(AX025730),SENV-D(AB059352),TTV(AB028668)的核苷酸序列同源性分别为90%,88%和91%;与2株D型SEN病毒SENV-D(AX025730),TTV(AB028668)ORF1所编码蛋白的氨基酸同源性分别为93%和92%.ORF1蛋白中含有Rep蛋白(在病毒复制中起作用的一种蛋白)的两个保守基序,此外还有一个保守的ATP/GTP结合基序(P-loop)以及若干个高度保守的蛋白激酶磷酸化位点.结论:测定得到了SENV-D亚型中国分离株的基因组序列,有助于其检测方法及致病性的研究,并为研究SEN病毒的进化地位提供方便.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王全立	军事医学科学院野战输血研究所	126	899	16.0	25.0
2	詹林盛	军事医学科学院野战输血研究所	64	450	11.0	19.0
3	王海平	军事医学科学院野战输血研究所	32	78	5.0	7.0
4	杜娟	军事医学科学院野战输血研究所	11	29	3.0	5.0
5	孟庆华	北京市佑安医院肝病三科	5	6	2.0	2.0
6	李娅		7	9	2.0	2.0