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摘要:
目的从日本血吸虫(Schistosoma japonicum, Sj)中国大陆株(chinese mainland strain)成虫cDNA文库中获得日本血吸虫新基因-组织蛋白酶B内切酶基因(Cathepsin B endopeptidase),利用生物信息学技术对其结构和功能进行分析和预测. 方法从已构建好的日本血吸虫成虫cDNA文库中挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行步移法测序获取全长cDNA,并进行生物信息学分析和登录;使用NCBI,SAPS,TMHMM,Signal,Psort II,Protscale和Scanprosite等软件对新基因的结构和功能进行分析和预测.结果对382个阳性克隆进行测序,获得部分新基因,其中包括组织蛋白酶B内切酶基因(AY226984).利用Internet在线分析和相关生物信息学软件对新基因的结构和功能进行了分析和预测.结论日本血吸虫组织蛋白酶B内切酶基因所编码蛋白为一跨膜蛋白,含有半胱胺酸蛋白酶结构域,可能对宿主血红蛋白具有降解作用,从而在日本血吸虫生长、发育过程中发挥作用.
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关键词云
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文献信息
篇名 日本血吸虫组织蛋白酶B肽链内切酶基因的获得及结构与功能分析
来源期刊 中国人兽共患病杂志 学科 医学
关键词 日本血吸虫 cDNA文库 克隆 步移法 生物信息学 组织蛋 白酶B肽链内切酶
年,卷(期) 2004,(9) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 790-793
页数 4页 分类号 R383.2
字数 4223字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1002-2694.2004.09.016
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 肖建华 南华大学病原生物研究所 75 276 9.0 12.0
2 张愉快 南华大学病原生物研究所 45 337 11.0 17.0
3 曾桥 南华大学病原生物研究所 22 74 5.0 7.0
4 万志刚 南华大学病原生物研究所 12 31 2.0 5.0
5 胡永轩 南华大学病原生物研究所 4 14 2.0 3.0
6 黄家芳 南华大学病原生物研究所 4 14 2.0 3.0
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研究主题发展历程
节点文献
日本血吸虫
cDNA文库
克隆
步移法
生物信息学
组织蛋 白酶B肽链内切酶
研究起点
研究来源
研究分支
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国人兽共患病学报
月刊
1002-2694
35-1284/R
大16开
福建省福州市津泰路76号
34-46
1985
chi
出版文献量(篇)
6893
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10
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38474
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