华支睾吸虫组织蛋白酶D样天冬氨酸蛋白酶全长基因的生物信息学分析

• 作者: 余新炳 徐劲 胡凤玉 胡旭初 赵俊红
• 来源期刊: 南华大学学报(医学版)
• 学科: 医学
• 关键词: 华支睾吸虫 组织蛋白酶D 天冬氨酸蛋白酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 21-24,53
• 页数: 5页
• 分类号: R51
• 字数: 3292字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1116.2009.01.007

摘要

目的 从华支睾吸虫成虫全长cDNA质粒文库中识别组织蛋白酶D样天冬氨酸蛋白酶基因,利用生物信息学方法预测其结构和功能特征,为进一步的实验研究提供理论指导. 方法利用生物信息学网站的在线分析工具和Vector NTI suite软件包,识别华支睾吸虫组织蛋白酶D样天冬氨酸蛋白酶基因,并预测其编码蛋白质的各种结构特征与功能特征,并根据该基因构建种系分子进化树. 结果 BLASTx分析该基因为全长基因,该基因全长1 459 bp,编码425个氨基酸,具有两个天冬氨酸蛋白酶的催化位点.SignalP分析该基因编码的蛋白质含有信号肽序列,切割位点在第17和第18个氨基酸之间,分子进化树提示其与日本血吸虫组织蛋白酶D样天冬氨酸蛋白酶亲缘关系最近. 结论组织蛋白酶D属于天冬氨酸蛋白酶家族,为分泌性蛋白,与日本血吸虫同源基因一致性最高,为后续实验筛选华支睾吸虫病的诊断抗原及药物靶标提供了必要的理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡凤玉	广州市第八人民医院传染病研究所	38	151	7.0	10.0