大片吸虫组织蛋白酶L全长序列的获取及其生物信息学分析

• 作者: 张为宇 罗洪林 黄维义
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大片吸虫 组织蛋白酶L 生物信息学
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 206-211
• 页数: 6页
• 分类号: S852.73+5|Q785
• 字数: 3964字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0366-6964.2008.02.013

摘要

根据文库载体序列与原组织蛋白酶表达序列标签(EST)设计引物,以大片吸虫cDNA文库为模板,进行Touchdown PCR与梯度PCR相结合的扩增反应,扩增产物克隆入pMD18-T载体,经鉴定后测序,并采用生物信息学技术对序列进行开放阅读框(ORF)、编码氨基酸序列、蛋白质同源性比较、二级、三级结构等分析;结果所获序列全长990 bp,编码330个氨基酸,分子量36 771.2 U,等电点5.44;具有较明显的螺旋、片层和无规卷曲等二级结构,α螺旋占17.3%,β折叠占27.0%,无规卷曲占55.8%;具有2个较明显的跨膜区和2个疏水区,未发现明显的信号肽和糖基化位点;氨基酸序列同源性比对显示其属于半胱氨酸家族;三级结构同源建模预测显示其与组织蛋白酶K(PDB number 2f7dA)有49%的一致性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄维义	广西大学动物科技学院	117	736	14.0	20.0
2	张为宇	广西大学动物科技学院	50	250	9.0	12.0
3	罗洪林	西南大学动物科技学院	14	114	7.0	10.0