一种关于蛋白质模体的自动识别算法

• 作者: 戈晓斐 胡磊 蔡振辉 黄晓
• 来源期刊: 微机发展
• 学科: 工学
• 关键词: 模体 算法 最大期望值算法 MEME算法
• 年，卷（期）: 2004,（10）
• 所属期刊栏目: 理论与算法研究
• 页码范围: 123-126
• 页数: 4页
• 分类号: TP301.6
• 字数: 3832字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-629X.2004.10.041

摘要

随着生物信息学的发展,模体识别已经成为一种能够从生物序列中提取有用生物信息的方法.文中介绍了有关模体的一些概念,讨论了模体识别算法(MEME)的基础,即EM(expectation maximization)算法,由于MEME算法是建立在EM算法的基础上的,所以又由此引出了MEME算法,并对MEME算法的一些基本问题比如时间复杂度、算法性能等进行了详细讨论,对算法的局限性和有待改进的地方作了说明.实践证明,MEME是一个较好的模体识别算法,它能够识别出蛋白质或者DNA序列中单个或多个模体,具有很大的灵活性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡磊	武汉大学计算机学院	32	133	7.0	9.0
2	戈晓斐	武汉大学计算机学院	3	15	2.0	3.0
3	黄晓		3	23	2.0	3.0
4	蔡振辉	苏州大学计算机科学与技术系	1	1	1.0	1.0