SEN病毒核酸异质性及准种现象的观察

• 作者: 周伯平 唐蔚 彭晓谋 杨山麦 王召钦 王辉 蒋晓玲
• 来源期刊: 世界华人消化杂志
• 学科: 医学
• 年，卷（期）: 2004,（3）
• 所属期刊栏目: 病毒性肝炎
• 页码范围: 604-606
• 页数: 3页
• 分类号: R511
• 字数: 2776字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-3079.2004.03.024

摘要

目的:报告SEN病毒核苷酸的异质性和准种特点.方法:取深圳地区SEN病毒流行病学调查得到的SENV D型或H型阳性血清各3份进行巢式PCR扩增,阳性PCR产物克隆至T载体,每份随机挑选1-11份阳性克隆进行分别测序,并与GeneBank上的北京株、美国株、意大利株和日本株进行比较分析.结果:挑选的16株克隆中D型和H型分别为13株和3株,均属于SENV序列.来自SZ-54的11株SENVD型克隆中准种占81.8%(9/11).本地3例患者的11株SENVD型阳性克隆与GeneBank的4株异地株,共15株间的同源性为77.7-99.5%.同一宿主9个克隆间的碱基变异个数为8.5±5.2,与同一地区不同宿主的11个克隆间的28.9±3.2和不同地区不同宿主的15个克隆间的29.6±7.8比较,有显著性差异(P均＜0.001).3株SENV H型阳性克隆与GeneBank的4株异地株共7株间的同源生为74.6-95.0%.进化分析表明,来自同一宿主的分离株遗传关系最近,同地区不同宿主的分离株其次,与4株异地分离株的遗传距离较远.结论:SENV核酸的变异性高,个体间存在较大差异,且在同一个感染者体内也存在大量SENV准种.在检测SENV的方法选择、比较SENV的序列差异和分析SENV的临床意义时应充分考虑到SENV的这种特性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王召钦		15	84	5.0	9.0
2	王辉		29	107	6.0	9.0
3	彭晓谋	中山大学附属第三医院传染病科	31	104	5.0	9.0
4	唐蔚		11	51	4.0	7.0
5	杨山麦		6	36	4.0	6.0
6	蒋晓玲		3	4	1.0	2.0