河南省HIV-1流行毒株pol基因的分型与系统发生分析

• 作者: 庄道民 李敬云 李林 李韩平 杨坤 鲍作义
• 来源期刊: 中国艾滋病性病
• 学科: 医学
• 关键词: 艾滋病毒1型(HIV-1) 基因亚型 系统发生分析
• 年，卷（期）: 2005,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 165-167
• 页数: 3页
• 分类号: R373.9|R512.91
• 字数: 1208字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5662.2005.03.002

摘要

目的了解河南省艾滋病病毒1型(HIV-1)流行毒株pol基因的亚型及其系统发生情况.方法采集河南省20名艾滋病病人的抗凝全血,分离血浆,用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增pol基因部分序列(PR与RT的p55区)并直接进行序列测定,登陆Web站点http://hiv-web.lanl.gov确定毒株亚型.用BioEdit和DNASTAR软件的MegAlign模块进行系统发生分析,SPSS软件包对数据进行统计学分析.结果20份标本的pol基因序列系统发生分析显示均为B亚型,且具有较高的系统发生同源性,与东北地区流行毒株的相似度≥97%,PR基因离散率＜0.2%,RT基因平均离散率为3.15%(0.7%～5.1%).PR和RT基因遗传变异的差异具有显著的统计学意义(P＜0.001).结论pol基因的系统发生分析可以作为河南省HIV-1毒株亚型确定的方法.河南与东北两地pol基因相似性以及PR与RT基因进化差异的意义,有待进一步研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李敬云	军事医学科学院微生物流行病研究所全军艾滋病检测中心	62	337	12.0	15.0
2	鲍作义	军事医学科学院微生物流行病研究所全军艾滋病检测中心	34	223	9.0	13.0
3	李林	军事医学科学院微生物流行病研究所全军艾滋病检测中心	17	249	7.0	15.0
4	李韩平	军事医学科学院微生物流行病研究所全军艾滋病检测中心	17	93	5.0	9.0
5	庄道民	军事医学科学院微生物流行病研究所全军艾滋病检测中心	15	95	5.0	9.0
6	杨坤	军事医学科学院微生物流行病研究所全军艾滋病检测中心	6	40	3.0	6.0