消化后片段长度差异等位基因特异性PCR技术--印记SNP rs220028多态性和甲基化模式研究

• 作者: 冯文芳 杨庆恩 赵贵森 黄代新
• 来源期刊: 中华医学遗传学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: DNA甲基化 甲基化敏感性限制酶 单核苷酸多态性 等位基因特异性聚合酶链反应
• 年，卷（期）: 2005,（1）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 58-60
• 页数: 3页
• 分类号: R3
• 字数: 2521字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j.issn:1003-9406.2005.01.014

摘要

目的建立一种能同时分析甲基化和单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的新方法. 方法以印记SNP rs220028(A/G)为例,基因组DNA经甲基化敏感限制酶消化后用片段长度差异等位基因特异性PCR(fragment length discrepant allele- specific PCR,FLDAS-PCR)分型;用扩增产物酶消化法来排除酶切位点序列变异,证实检出的是甲基化等位基因.结果消化后FLDAS-PCR可选择性检出甲基化等位基因,家系分析表明其来自母亲.等位基因频率A=0.5085,G=0.4915,多态信息含量为0.3749. 结论消化后FLDAS-PCR技术可以实现甲基化和SNP的复合分析;印记SNP rs220028在 Prader-Willi/Angelman 综合征诊断中有潜在意义.