片段长度差异等位基因特异性PCR-一种改良的SNP分型新方法

• 作者: 杨庆恩 赵贵森 黄代新
• 来源期刊: 法医学杂志
• 学科: 政治法律
• 关键词: 单核苷酸多态性 片段长度差异等位基因特异性PCR 碱基错配
• 年，卷（期）: 2005,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 11-14
• 页数: 4页
• 分类号: DF795.2
• 字数: 3345字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-5619.2005.01.004

摘要

目的建立一种基于等位基因特异性PCR原理的改良SNP分型新方法:片段长度差异等位基因特异性PCR,并考察特异性引物的3'端第3位、第4位碱基错配对特异性延伸的影响.方法以SNP位点rs759117和rs760887为例,设计两条长度不同、3'末端分别与SNP两个等位基因碱基配对的上游引物,同时在两个等位基因特异性引物3'端第3或第4位碱基引入错配以增加特异性,下游为公用引物.PCR产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染显带后确定样本的基因型.结果不同SNP纯合子为长度不同的单一谱带,杂合子则为两条带,其结果与直接测序完全一致.两条特异性上游引物3'端第3或第4位碱基引入错配后非特异性延伸显著减少,且对PCR反应条件的严格性要求明显降低.结论片段长度差异等位基因特异性PCR是一种简单快速而有效的SNP分型新方法;两条特异性引物3'端第3、第4位碱基引入错配可使特异性显著增加.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄代新	华中科技大学同济医学院法医学系	64	409	9.0	17.0
2	杨庆恩	华中科技大学同济医学院法医学系	64	533	11.0	20.0
3	赵贵森	华中科技大学同济医学院法医学系	10	92	4.0	9.0