核盘菌arom基因的克隆与序列分析

• 作者: 于寒颖 李常银 杨谦
• 来源期刊: 林业研究（英文版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 核盘菌 arom基因 基因克隆
• 年，卷（期）: 2005,（4）
• 页码范围: 260-264
• 页数: 5页
• 分类号: Q781
• 语种: 英文

摘要

本文用反向PCR方法扩增并分析了核盘菌arom基因,以研究核盘菌和其他真菌在该基因之间的进化关系,并为其编码蛋白(AROM)的催化机制研究、植物转基因和蛋白抑制剂设计提供基础.arom基因编码预分支酸芳香族氨基酸(苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸)合成途径中催化第二步到第六步的五功能多肽.序列分析表明核盘菌arom基因含有一个4773bp的编码框,无内含子.推测的蛋白序列含有1590个氨基酸,与已知的所有AROM蛋白同源.理论分子量(Mw)和等电点(pI)分别是172658.78D和6.45.核盘菌arom基因的GC%是44.94%.根据搜索二级数据库CDD和Prosite的结果表明该AROM蛋白含有五个保守结构域:脱氢奎尼酸合成酶结构域、脱氢奎尼酸脱水酶(脱氢奎尼酸酶)结构域、莽草酸脱氢酶结构域、莽草酸激酶结构域、5 -烯醇丙酮酰莽草酸-3-磷酸合成酶(EPSP合成酶)结构域和四个模式:两个EPSP合成酶模式、Ⅰ型脱氢奎尼酸酶活性位点模式和莽草酸激酶模式.通过比对和参照PIR 数据库显著位点规则发现核盘菌AROM蛋白含有四个保守碱基.在基因5′非翻译区-23和-77位置分别存在TATA盒和CAAT盒.在基因下游发现有两个位点可能是polyA加尾信号.另外还分析了arom基因的系统发育.图5参13.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨谦	哈尔滨工业大学生命科学与工程系	191	3458	29.0	49.0
2	于寒颖	哈尔滨工业大学生命科学与工程系	8	26	3.0	4.0
4	李常银	哈尔滨工业大学生命科学与工程系	5	124	4.0	5.0