核盘菌AROM蛋白的三级结构分析

• 作者: 于寒颖 杨谦
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: AROM蛋白 核盘菌 结构建模
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 8-11
• 页数: 4页
• 分类号: Q5
• 字数: 2709字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2007.01.003

摘要

核盘菌编码AROM蛋白的arom基因已经被克隆测序,本文根据该基因翻译的氨基酸序列用同源模建方法和从头模建方法分析了AROM蛋白各结构域的三级结构和功能位点,以及该蛋白二聚体可能的组装方式.结果表明,核盘菌AROM蛋白的脱氢奎尼酸合酶结构域进一步由N-端含有一个Rossmann折叠的α/β结构域和C-端的α螺旋结构域组成;5-烯醇丙酮酰莽草酸-3-磷酸合酶结构域则由两个相似结构域组成,每个结构域含有不同拷贝数的β折叠和α螺旋;莽草酸激酶结构域的N-端由三个β折叠组成;脱氢奎尼酸酶结构域为(α2β2)3多肽,在N-端有一对反平行的β链,在C-端有loop环;莽草酸脱氢酶结构域含有一个由α/β组成的催化结构域和一个含有Rossmann折叠的NADPH结合结构域.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨谦	哈尔滨工业大学生命科学与工程系	191	3458	29.0	49.0
2	于寒颖	哈尔滨工业大学生命科学与工程系	8	26	3.0	4.0