籼稻品种Kasalath BAC克隆的终端序列分析和染色体制图

• 作者: 谢国禄（摘译）
• 来源期刊: 作物育种信息
• 学科: 农学
• 关键词: BAC克隆 人工染色体 籼稻品种 序列分析 终端 制图 基因组序列 表型多样性 序列同源性
• 年，卷（期）: 2005,（8）
• 页码范围: 11
• 页数: 1页
• 分类号: S511

摘要

为了调查水稻种（Oryza sativa）内的表型多样性和进化关系，我们对衍生于籼稻品种Kasalath的BAC（细菌性人工染色体）克隆进行了大范围的终端排序和染色体in silico制图（根据序列同源性进行制图）。从47194个BAC克隆中总共获得了78427个高质量的BAC-终端序列（BES）；这些终端序列表现出总共具有37．8Mb基因组序列的482bp的平均阅读长度。排除含有重复序列的这些BES并使用粳稻品种日本晴的高质量基因组序列作为参照标准后，把这些具有成对BES的12170个克隆绘制到了12条染色体上。这些克隆由4．50个重叠群组成，