利用神经网络集成预测MHC-Ⅰ类分子结合肽

• 作者: 何贤辉 刘顺会 曾安 曾耀英 郑启伦 韩博平
• 来源期刊: 中国病理生理杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 主要组织相容性复合物 人工神经网络 神经网络集成 T细胞表位预测 结合肽
• 年，卷（期）: 2005,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 894-897
• 页数: 4页
• 分类号: R363
• 字数: 2985字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-4718.2005.05.014

摘要

目的:利用神经网络集成(NNE)预测MHC-Ⅰ类分子结合肽. 方法: 基于HLA-A·0201编码的MHC-Ⅰ类分子结合肽数据库(含有628个9聚物)及其结合能力分类,利用NNE分别对具有无、低、中和高4类亲合性的结合肽进行分类预测;同时还进一步利用T细胞真实表位集(含50个表位)评估了NNE的预测性能. 结果: 集成数为12的NNE对上述分类的平均预测命中率可达0.8,而且NNE对潜在T细胞表位的预测能力也较高,约84%的真实表位归于高和中等亲合性的潜在抗原肽一类. 结论: 可以利用神经网络集成预测MHC-Ⅰ类分子结合肽,并进而预测相应的T细胞表位.经适当修改,NNE预测工具可扩展为能涵盖任意长度的Ⅰ类分子结合肽甚至可扩展到Ⅱ类分子结合肽的预测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾耀英	暨南大学组织移植和免疫中心	300	2350	22.0	32.0
2	韩博平	暨南大学水生生物研究所	192	4189	32.0	56.0
3	何贤辉	暨南大学组织移植和免疫中心	98	770	16.0	23.0
4	郑启伦	华南理工大学计算机科学与工程系	103	1003	17.0	26.0
5	刘顺会	暨南大学组织移植和免疫中心	5	44	3.0	5.0
9	曾安	华南理工大学计算机科学与工程系	9	102	5.0	9.0