光棘球海胆的主要卵黄蛋白cDNA序列分析

• 作者: 包振民 周遵春 王丽梅 董颖 赫崇波 韩家波
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 光棘球海胆 主要卵黄蛋白cDNA 序列分析
• 年，卷（期）: 2006,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 352-359
• 页数: 8页
• 分类号: Q78
• 字数: 4251字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2006.03.003

摘要

提取成熟光棘球海胆(Strongylocentrotus nudus)性腺中的RNA做模板,根据NCBI数据库中已知海胆(编号:AB097218、AB192414、AY090112)主要卵黄蛋白MYP cDNA保守序列设计引物,用LAPCR方式分段扩增并测序得到了光棘球海胆MYP cDNA的全序列.扩增的cDNA全长4 061 bp,包含4 047bp的开放阅读框,共编码1 349个氨基酸.用CluxtalX1.83对光棘球海胆与其他几种已知海胆MYP cDNA及推导的氨基酸序列进行比对,用Mega3.01计算遗传距离及构建进化树,结果表明,光棘球海胆与其他7种海胆的MYP具有高度的同源性.从氨基酸水平上看,光棘球海胆与红海胆(Pseudocentrotusdepressus)亲缘关系最近,遗传距离为0.069±0.01;与同科的马粪海胆(Hemicentrotus pulcherrimus)、紫球海胆(S.purpuratus)、中间球海胆(S.intermedius)的遗传距离分别是0.095±0.012、0.098±0.011和0.101±0.012;与白棘三列海胆(Tripneustes gratilla)、拟球海胆(Paracentrotus lividus)及绿海胆(Lytechinus variegatus)亲缘关系相对较远,遗传距离分别是0.216±0.017、0.218±0.017和0.535±0.028.获得光棘球海胆MYP cDNA 序列可为进一步研究MYP基因的功能和系统的进化分析奠定基础.[中国水产科学,2006,13(3):352-359]