基于DNA序列LZ复杂性距离的系统进化树重构

• 作者: 何红波 李义兵 李斌
• 来源期刊: 高技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 生物信息学 系统进化树重构 条件LZ复杂性 LZ复杂性距离
• 年，卷（期）: 2006,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 506-510
• 页数: 5页
• 分类号: Q81
• 字数: 5123字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-0470.2006.05.013

摘要

根据LZ复杂性的原理,提出了序列间条件LZ复杂性的概念.基于条件LZ复杂性,定义了非空序列间的LZ复杂性距离.选取20种有胎盘哺乳动物,以它们的全线粒体基因组作为分子数据,计算两两之间的LZ复杂性距离,得出距离矩阵.根据计算出的LZ复杂性距离矩阵重构了20种有胎盘哺乳动物的系统进化树.基于LZ复杂性距离所得的系统进化树支持有胎盘哺乳动物中的灵长动物(Primates)、原蹄动物(Ferungulate)和啮齿动物(Rodents)三者之间灵长动物与原蹄动物之间亲缘关系更近一些的观点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李义兵	中南大学物理学院	50	408	12.0	17.0
2	李斌	中南大学信息科学与工程学院	144	1053	18.0	27.0
3	何红波	中南大学物理学院	30	124	7.0	10.0