大肠杆菌mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性的关系

• 作者: 刘次全 曹槐 王侃 陈雪峰
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 大肠杆菌 密码子偏好性 mRNA编码区 mRNA二级结构 翻译效率
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传学和分子生物学
• 页码范围: 895-899
• 页数: 5页
• 分类号: Q78
• 字数: 4971字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0001-6209.2006.06.008

摘要

从GenBank获得大肠杆菌K-12 MG1655株的全基因组序列,计算了与基因密码子偏好性相关的多个参数(Nc、CAI、GC、GC3s),对其mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性之间的关系进行了统计学分析,发现虽然翻译效率(包括翻译速度和翻译精度)是制约大肠杆菌高表达基因的密码子偏好性的主要因素,同时,mRNA编码区长度及其形成二级结构的倾向也是形成这种偏好性的不可忽略的原因,而且对偏好性有一定程度的削弱.另外对mRNA编码区形成二级结构倾向的生物学意义进行了讨论分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘次全	云南大学现代生物学中心	36	289	8.0	16.0
13	曹槐	云南大学现代生物学中心	37	288	8.0	15.0
14	陈雪峰	云南大学现代生物学中心	2	28	2.0	2.0
15	王侃	云南大学现代生物学中心	1	16	1.0	1.0