一株野生鹧鸪源冠状病毒主要结构基因进化特性分析

• 作者: 付家栋 任涛 廖明 张桂红 曹伟胜 罗开健 辛朝安
• 来源期刊: 自然科学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 野生 鹧鸪 冠状病毒 结构基因 进化分析
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 学术论文
• 页码范围: 433-438
• 页数: 6页
• 分类号: Q81
• 字数: 3343字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-008X.2006.04.008

摘要

从野生禽类鹧鸪的喉气管拭子中分离到1株冠状病毒,命名为Partridge/GD/S14/2003(简写为S14).通过RT-PCR扩增、克隆测序获得了该毒株的全基因组序列(AY646283),序列经DNAstar分析发现,S14毒株与肾型毒株JX1-99,TJ2-96 S1基因同源性最高,分别达到94.6%和93.4%,并且该毒株的S1基因还和QXIBV,LX4株也存在高度亲缘性,分别达到85%和84.3%,同时对S14 S1基因BLAST时发现只有上述毒株和S14有高度同源.由此推测该鹧鸪分离株S14的进化可能与IBV肾型和腺胃型病毒存在一定关系.序列分析表明,S14毒株与Gen-Bank中注册序列QXIBV,LX4的S2基因同源性最高分别达到97.2%和90.6%,都处于Ⅱ群.M基因系统进化树研究发现,S14处于Ⅲ群,与SAIB20,GD6-98同源性最高,分别达到90.6%和90.2%;而与其S1,S2基因同源较高的BJ,QXIBV株,M基因的进化关系却较远.N基因同源性和系统进化树分析发现,Ⅰ群毒株可能为H52和Gray株发生重组的结果,Ⅱ群毒株可能为H120和D1466等毒株重组的结果,而S14株处于Ⅲ群,其N基因与QXIBV高度同源,达到95.7%,Ⅳ群为肾型分离株.而与其M基因亲缘性最近的SAIB20,GD6 98则分处Ⅰ,Ⅳ进化群.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	廖明	华南农业大学兽医学院	182	1407	18.0	31.0
2	辛朝安	华南农业大学兽医学院	134	1303	20.0	34.0
3	曹伟胜	华南农业大学兽医学院	59	180	7.0	11.0
4	罗开健	华南农业大学兽医学院	76	355	10.0	16.0
5	张桂红	华南农业大学兽医学院	162	778	14.0	21.0
6	任涛	华南农业大学兽医学院	84	330	10.0	16.0
7	付家栋	华南农业大学兽医学院	2	6	2.0	2.0