两种鲷属鱼类线粒体COI基因片段序列的比较

• 作者: 夏连军 张凤英 施兆鸿 马凌波 马春艳
• 来源期刊: 上海水产大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鲷属 线粒体DNA 细胞色素氧化酶Ⅰ亚基基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 页码范围: 403-408
• 页数: 6页
• 分类号: S917
• 字数: 3241字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-7271.2006.04.004

摘要

利用通用引物成功扩增了黄鳍鲷和黑鲷的线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ亚基(COI)基因序列.通过序列测定,得到581bp的基因片段,碱基A、T、G、C平均含量分别为25.8%、32.6%、18.0%和23.6%,序列中的A+T含量明显高于G+C含量,与其他鱼类的COI基因片段研究结果相一致.通过序列分析发现黄鳍鲷和黑鲷两序列共存在14处碱基变异,其中在第19～139 bp之间检测到13个变异位点,是变异频率较高的区段,可以考虑作为鲷属或者种群鉴别的分子标记.与黄鲷、真鲷、三长棘真鲷等鱼类比较,无插入和缺失位点,转换明显高于颠换.序列差异比较结果显示,真鲷与黄鳍鲷的序列差异在这5种鱼类中最大,达到了18.2%,黄鳍鲷和黑鲷的差异最小(2.4%).两个序列已提交到GenBank数据库中,序列登录号为:DQ185608和DQ185609.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	夏连军	中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业重点开放实验室	39	466	11.0	21.0
2	施兆鸿	中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业重点开放实验室	96	1874	26.0	39.0
3	张凤英	中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业重点开放实验室	25	488	13.0	22.0
4	马凌波	中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业重点开放实验室	28	483	12.0	21.0
5	马春艳	中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业重点开放实验室	16	325	9.0	16.0