原核表达中优化起始密码下游序列的软件设计与实现

• 作者: 周晓巍 李涛 许龙 黄培堂
• 来源期刊: 生物工程学报
• 学科: 生物学
• 关键词: DB序列 16SrRNA 序列匹配性 基因表达 软件设计
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1032-1035
• 页数: 4页
• 分类号: Q786
• 字数: 3846字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3061.2006.06.028

摘要

在原核表达中影响外源基因表达效率的因素有很多,这其中翻译起始效率起了非常重要的作用.翻译起始效率又主要受SD序列、SD序列与起始密码子之间的间距、DB(Downstream Box)序列、mRNA翻译起始区(TIR)的二级结构和稀有密码子等因素的影响.主要针对DB序列和5′端稀有密码子的优化设计了软件.通过计算机对序列进行分析比对后,按照匹配碱基数、匹配位置、密码子使用频率平均值的顺序进行排序,给出一些优化序列,并给出了软件算法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄培堂	军事医学科学院生物工程研究所	190	1493	20.0	30.0
2	周晓巍	军事医学科学院生物工程研究所	43	220	8.0	13.0
3	李涛	军事医学科学院国家生物医学分析中心	16	28	4.0	5.0
4	许龙	军事医学科学院生物工程研究所	10	32	3.0	5.0