我国HIV-1 B'亚型流行株vif基因序列特征及变异分析

• 作者: 刘思扬 刘永健 庄道民 李敬云 李林 李韩平 鲍作义
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 人免疫缺陷病毒 vif基因
• 年，卷（期）: 2006,（8）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 743-746
• 页数: 4页
• 分类号: R3
• 字数: 2430字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2006.08.019

摘要

目的 研究人免疫缺陷病毒-1(HIV-1)B'亚型vif基因的变异特征,探讨其与HIV传播和致病性之间的关系.方法 采集河南省部分HIV感染者的外周血,提取41例HIV感染者外周血淋巴细胞DNA,设计特异性引物扩增其前病毒基因组中的vif基因,对于扩增阳性的29例PCR产物进行vif区基因的测序及分析.结果 29条vif基因的平均离散率是0.0328,突变主要集中于90～120、270～302、372～405、450～470四个区域.Vif多肽链的90～93位和157～160位存在两个富含R和K带有强烈正电荷的亲水区,带正电荷的R或K交替出现,几乎没有其他的氨基酸残基.29个Vif多肽链有21条在90～93位存在R90 RKR93基序;有26条在157～160位存在K157 RRK160基序,29条序列在114位和133位存在两个在HIV-1和HIV-2以及SIV内保守的半胱氨酸(A).结论 vif在HⅣ-1基因组内具有相对保守性,其特征性区域和氨基酸基序对于保持Vif蛋白的功能是十分重要的.