甘薯NBS类抗病基因类似物的分离与序列分析

• 作者: 周以飞 林生 潘大仁 陈观水
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 甘薯 NBS 抗病基因类似物 基因分离 序列分析
• 年，卷（期）: 2006,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 359-365
• 页数: 7页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 4581字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2006.05.001

摘要

利用已克隆植物抗病基因NBS(Nucleotide binding site)序列中的保守模体(motif)"P-loop"和"GLPL"合成简并引物,以甘薯(Ipomoea batatas)栽培品种青农2号基因组DNA为模板进行PCR扩增,通过T/A克隆、测序和序列分析,共得到15条具有连续ORF的抗病基因类似物(Resistance gene analogues,RGAs)序列,它们之间核苷酸序列间的相似性系数在41.2%-99.4%之间,而相应推测的氨基酸序列间的相似性系数在20.6%-100%之间,同时对分离的RGAs的核苷酸和氨基酸序列进行系统发育树分析,表明甘薯RGAs可分为TIR(Drosophila Toll or human interleukin receptor-like)和nonTIR两类.对甘薯RGAs和5个已克隆植物NBS的氨基酸序列进行结构分析表明,它们包括"P-loop"、"Kinase-2"、"Kinase-3a"、"GLPL"4个抗病基因所共有的保守模体.这些表明甘薯与其它物种的NBS类RGAs可能具有同样的起源和进化机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘大仁	福建农林大学生命科学学院	87	682	14.0	21.0
2	周以飞	福建农林大学作物科学学院	50	446	11.0	18.0
3	陈观水	福建农林大学生命科学学院	28	182	7.0	12.0
4	林生	福建农林大学作物科学学院	12	188	5.0	12.0