中国人手足裂畸形患者中染色体10q24.3区域DNA重复突变的鉴定

• 作者: 余晓芬 刘扬 张学 张爱英 张爱菊 敖杨 李气环 杨威 罗会元 胡周军 邓曦 高春生
• 来源期刊: 中华医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肢畸形,先天性 基因,重复 TP63基因 手足裂畸形
• 年，卷（期）: 2006,（10）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 652-658
• 页数: 7页
• 分类号: R6
• 字数: 4184字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0376-2491.2006.10.002

摘要

目的鉴定一个中国人手足裂畸形(SHFM)家系的致病突变,揭示该家系中手足裂畸形发生的分子遗传基础.方法回顾家系(4代共5例患者)中3例患者已有X线检查资料,补拍畸形手足外观照片.采集其中2例患者外周血进行高分辨G显带核型分析.从现有4名家系成员(包括3例患者)外周血样品中提取基因组DNA.针对TP63基因全部16个外显子(包括外显子/内含子交界区)设计并合成引物,以1例患者基因组DNA为模板进行聚合酶链反应(PCR)扩增和产物直接测序.在已知的5个SHFM位点染色体区域选择微卫星标记,通过PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳分析家系成员的基因型.对染色体10q24.3区域SHFM3位点内微卫星标记的多态片段进行测序分析,比较患者和基因型相同的正常对照个体不同等位片段测序峰高度的差别.结果家系中现存3例患者双手均为桡侧指/掌骨缺失,2例患者双足表现中央轴趾/跖骨缺失,1例患者双足仅剩腓侧趾/跖骨,都符合典型手足裂畸形的临床表现.对患者进行高分辨G显带核型分析,未见染色体数目异常或结构畸变;对患者DNA进行TP63基因测序,未发现突变.通过检测微卫星标记进行基因型分析,发现患者在SHFM1、SHFM4和SHFM5三个位点不表现单体型共享,而在SHFM2和SHFM3两个位点则共享某一单体型,提示本家系中手足裂畸形表型可能由SHFM2或SHFM3位点的突变引起.进一步分析SHFM2和SHFM3两个位点微卫星标记的聚丙烯酰胺凝胶电泳结果,发现患者在SHFM3位点的患者共享等位片段呈现信号增强现象.以相同基因型正常人为对照个体进行微卫星标记的比较测序分析,发现患者间共享等位片段的测序峰在患者中增高约1倍.以上结果表明,本家系患者发生了SHFM3位点内的DNA重复.结论首次在中国人手足裂畸形患者中发现染色体10q24.3区域DNA重复突变.