八肋游仆虫Rab家族新成员Eo-rab-1N基因的克隆与序列分析

• 作者: 孙永华 李凌燕 柴宝峰 梁爱华 王伟
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 生物学
• 关键词: 八肋游仆虫 Eo-rab-1N基因 基因克隆 内含子
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 437-442
• 页数: 6页
• 分类号: Q343
• 字数: 3831字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2006.04.012

摘要

Rab蛋白家族属于小分子GTP结合蛋白家族Ras超家族中最大的亚家族,主要在囊泡运输中起作用.实验运用PCR、RT-PCR等技术,从八肋游仆虫中克隆到一种新的rab基因.序列分析结果表明:在大核中,该基因全长884 bp,除去两端的端粒与非编码区,该基因在大核中由723bp组成.从小核中克隆相应的基因片段,此基因片段序列与大核中序列一致,表明该基因在小核中无内部删除序列的存在.通过RT-PCR,从mRNA获得的该基因的开放读框为663 bp,表明该基因在转录过程中有内含子的删除.大核基因序列和cDNA序列比较,发现60 bp的内含子序列位于大核基因的153～212 bp之间,并符合一类内含子GU-AG剪切规则.在遗传密码使用上,该基因内部含有2个TGA,在游仆虫中编码半胱氨酸.同时首次发现,八肋游仆虫基因使用TAG作为终止密码子.NCBI上序列比对表明该基因翻译的蛋白与其他物种Rab1蛋白的同源性达49%～52%,因此我们将它命名为Eo-rab-1N,GenBank登录号为DQ105562.Eo-rab-1N与其他物种的Rab1蛋白构建进化树,发现该蛋白的进化与物种的进化保持一致,表明该基因在细胞中具有重要功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙永华	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	18	224	7.0	14.0
2	梁爱华	山西大学生物技术研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室	97	555	13.0	18.0
3	柴宝峰	山西大学生物技术研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室	72	1241	15.0	34.0
4	王伟	山西大学生物技术研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室	78	319	11.0	15.0
5	李凌燕	山西大学生物技术研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室	1	9	1.0	1.0