影响H<em>5</em>N1甲型流感病毒对哺乳动物毒力变异的HA序列关键位点研究

• 作者: 姜庆五 张文彤 许慧琳 赵耐青
• 来源期刊: 世界感染杂志
• 年，卷（期）: 2006,（5）
• 所属期刊栏目: 文摘
• 页码范围: 473
• 页数: 1页
• 语种: 中文

摘要

目的 筛选影响H5N1亚型甲型流感病毒对哺乳动物毒力变异的HA序列主要氨基酸位点.方法 根据相关文献提供的实验结果,将54株H5N1病毒株按其对哺乳动物的毒力强弱分为高毒力组和低毒力组,在NCB□Genbank数据库中下载HA基因序列,用随机森林模型完成主要变异氨基酸位点的筛选.结果 在HA序列中共筛选出8个关键位点,均位于HA1节段,分别为:279、102、228、156、154、172、140、8.位点154和156与其余几个关键位点间、位点140与172间均存在较强的协同交互作用,用上述关键位点重建的随机森林模型对病毒株毒力分类的准确率为83.33%.结论 所筛选出的8个变异位点可能在决定H5N1病毒毒力上起关键作用,值得对其分子生物学作用机理做深入研究.