基于Java的基因本体工具包

• 作者: 张国庆 李亦学 骆清铭 鲁强
• 来源期刊: 高技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因本体 解析器 图模型 语义相似性
• 年，卷（期）: 2006,（7）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 735-739
• 页数: 5页
• 分类号: Q81
• 字数: 4605字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-0470.2006.07.015

摘要

针对基因本体的需求,利用Java技术,以模块化设计的方式实现了基因本体工具包GO4J.该系统包括4个模块.解析器模块把GO载入到内存中;图数据结构模块记录了所有的GO条目之间的关系;语义相似性模块评估两个GO条目之间的相似程度;可视化模块直观展示GO条目和根节点之间的路径.GO4J把这4个模块整合到本体浏览器中,可以结合GO注释的生物数据来对具体的生物数据进行分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	骆清铭	华中科技大学湖北省生物信息与分子成像重点实验室	125	1061	18.0	22.0
2	鲁强	华中科技大学湖北省生物信息与分子成像重点实验室	29	174	8.0	11.0
3	张国庆	华中科技大学湖北省生物信息与分子成像重点实验室	7	34	4.0	5.0
4	李亦学		1	2	1.0	1.0