Weighted SVM在蛋白质磷酸化位点预测中的应用

• 作者: 刘颖 覃征 赵凌志
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: Weighted SVM 蛋白质磷酸化 生物信息学 数据挖掘
• 年，卷（期）: 2006,（3）
• 所属期刊栏目: 数据库与信息处理
• 页码范围: 155-157,167
• 页数: 4页
• 分类号: TP391
• 字数: 5178字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-8331.2006.03.045

摘要

Weighted SVM是标准SVM针对非均衡样本的改进.首次将Weighted SVM用于蛋白质磷酸化位点的预测,在最新版的蛋白质磷酸化数据集PhosphoBase上,取得了目前为止最好的分类精度.k-fold交叉验证和独立测试集实验的结果表明,通过对样本数相对较少的正样本赋予较大的惩罚参数,Weighted SVM有效地改善了分类器向负样本方向的"偏斜",提高了总的预测正确率以及(正样本)查全率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	覃征	清华大学软件学院	74	970	19.0	27.0
2	刘颖	清华大学软件学院	50	235	9.0	12.0
3	赵凌志	清华大学软件学院	1	9	1.0	1.0