一种基于类均值的肿瘤基因芯片数据的标准化方法

• 作者: 王广云 王正志 邱浪波
• 来源期刊: 生命科学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 肿瘤基因芯片 聚类分析 标准化 中心化 相关系数
• 年，卷（期）: 2007,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 206-211
• 页数: 6页
• 分类号: Q332
• 字数: 4946字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7847.2007.03.004

摘要

分析了当前常用的标准化方法在肿瘤基因芯片中引起错误分类的原因,提出了一种基于类均值的标准化方法.该方法对基因表达谱进行双向标准化,并将标准化过程与聚类过程相互缠绕,利用聚类结果来修正参照表达水平.选取了5组肿瘤基因芯片数据,用层次聚类和K-均值聚类算法在不同的方差水平上分别对常用的标准化和基于类均值的标准化处理后的基因表达数据进行聚类分析比较.实验结果表明,基于类均值的标准化方法能有效提高肿瘤基因表达谱聚类结果的质量.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邱浪波	空军工程大学电讯工程学院	17	84	5.0	9.0
2	王正志	国防科技大学机电工程与自动化学院	85	629	13.0	20.0
3	王广云	国防科技大学机电工程与自动化学院	11	31	4.0	5.0