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摘要:
[目的]揭示侵染中国甘蔗及玉米的甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus,SCMV)的遗传多样性,为抗病品种培育及病害综合防治提供依据.[方法]以病株叶组织总RNA抽提物为模板,通过RT-PCR扩增及扩增产物直接测序获得了华南地区SCMV 26个甘蔗及玉米田间分离物的近全长CP基因序列,结合GenBank中已公布的部分相应序列,采用序列比对及分子系统进化树重建方法,对SCMV CP基因序列的变异性进行分析.[结果]中国SCMV可分为3个分子组群,各组群分别对应于各自来源的寄主,即杂种甘蔗(糖用甘蔗, Saccharum interspecific hybrids)、玉米(Zea mays)和高贵甘蔗(果用甘蔗,Saccharum officinarum).CP基因核苷酸同一性,不同组群之间为78%~84%,同一组群内部各分离物之间大于91%.在分子系统进化树中,这3个分子组群各自聚集成簇,前两个组群分别隶属于Alegria等(2003)建立的甘蔗组(sugarcane group,SCE 组)和玉米组(maize group,MZ组),第3个组群为本研究首次发现,命名为高贵甘蔗组(noble sugarcane group,NSCE组).侵染杂种甘蔗的SEC组不存在明显的地域分化,而侵染玉米和高贵甘蔗的MZ组和NSEC组则可对应地理来源分为若干亚组,前者可分为华东华中亚组、西北西南亚组及华南亚组,后者至少包括华南亚组和浙江亚组.在玉米、杂种甘蔗及高贵甘蔗混栽区,不同作物上的SCMV可以通过蚜虫传播而交叉侵染,但各组群间依寄主种类存在相对隔离现象.本研究还发现中国华南地区,SCMV可自然侵染甘蔗近缘属杂草河八王(Narenga sp.)和芒(Miscanthus sp.).[结论]在中国,SCMV存在丰富的遗传多样性,其分化与寄主类型密切相关,可分为杂种甘蔗组、玉米组和高贵甘蔗组,其中玉米组和高贵甘蔗组又可根据地理来源分为若干亚组.在抗病品种的选育及病害综合防治中,必须充分考虑到病毒的这种分化现象.
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文献信息
篇名 侵染中国甘蔗和玉米的SCMV CP基因序列多样性分析
来源期刊 中国农业科学 学科 农学
关键词 甘蔗花叶病毒 CP基因 序列分析 遗传分化
年,卷(期) 2007,(1) 所属期刊栏目 植物保护
研究方向 页码范围 84-91
页数 8页 分类号 S4
字数 6342字 语种 中文
DOI 10.3321/j.issn:0578-1752.2007.01.012
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 周国辉 华南农业大学资源环境学院 56 1146 18.0 32.0
2 陈晓琴 华南农业大学资源环境学院 6 100 5.0 6.0
3 许东林 华南农业大学资源环境学院 16 222 10.0 14.0
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节点文献
甘蔗花叶病毒
CP基因
序列分析
遗传分化
研究起点
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
半月刊
0578-1752
11-1328/S
大16开
北京中关村南大街12号
2-138
1960
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
相关基金
广东省科技攻关计划
英文译名:
官方网址:http://www.gdstc.gov.cn/other/kjjhgl_nykjggjh.htm
项目类型:
学科类型:
广东省自然科学基金
英文译名:Guangdong Natural Science Foundation
官方网址:http://gdsf.gdstc.gov.cn/
项目类型:研究团队
学科类型:
论文1v1指导