家蚕核型多角体病毒ORF 75基因的生物信息学分析

• 作者: 安世恒 尹新明 杨永青 江志伟 胡鹏 郭征
• 来源期刊: 河南农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 家蚕 核型多角体病毒 ORF 75基因 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2007,（6）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 641-646
• 页数: 6页
• 分类号: Q78
• 字数: 3048字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2340.2007.06.011

摘要

通过对家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori,nucleopolyhedrovirus: BmNPV)ORF 75基因核苷酸序列进行生物信息学分析,BmNPV ORF 75基因位于病毒基因组70 485 bp和71 264 bp之间,编码259个氨基酸残基的多肽,预测分子相对质量为30.8 kDa,等电点为7.67,分子式为C1409H2157N351O390S19;蛋白在大肠杆菌内的半衰期大于10 h;酸性氨基酸(Asp + Glu)占10.5%,碱性氨基酸(Arg + Lys)占10.8%;蛋白的不稳定指数为42.67,是不稳定蛋白.利用Prosite数据库扫描,查到4类9个蛋白修饰位点.通过Blast搜索氨基酸同源序列发现,BmNPV ORF 75同源蛋白存在于所有测序的鳞翅目昆虫杆状病毒中,不存在于其他非鳞翅目昆虫杆状病毒中.同源序列比对结果,BmNPV ORF 75蛋白的氨基酸序列与苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒(Autographa californica MNPV) ORF 92之间的同源性达到100%,应为相同基因.依照BmNPV ORF 75同源基因序列相似性,对13种昆虫杆状病毒进行进化树构建分析,其中,BmNPV ORF 75与薄荷灰夜蛾多粒包埋型核型多角体病毒(Rachiplusia ou MNPV) ORF 89基因进化距离很近,同源性较高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	安世恒	河南农业大学植物保护学院	39	184	8.0	11.0
2	杨永青		8	37	3.0	6.0
3	尹新明	河南农业大学植物保护学院	68	577	13.0	21.0
4	江志伟	河南农业大学植物保护学院	2	2	1.0	1.0
5	胡鹏	河南农业大学植物保护学院	3	2	1.0	1.0
6	郭征		4	17	2.0	4.0