小麦多酚氧化酶(PPO)基因的分类及非同义cSNP对籽粒PPO活性的影响

• 作者: 何贤芳 司红起 王晓波 马传喜
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 小麦 基因 多酚氧化酶 分子标记 多重PCR
• 年，卷（期）: 2007,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 970-975
• 页数: 6页
• 分类号: S188
• 字数: 4752字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2007.06.011

摘要

小麦(Triticum aestivum)籽粒多酚氧化酶(PPO)活性是影响面团褐变的主要原因.通过对NCBI上注册的小麦PPO基因序列的搜索与比对后发现,现有的小麦PPO基因按表达方式可分为两大类(Ⅰ和Ⅱ),其中第Ⅱ大类的PPO基因与小麦籽粒PPO活性密切相关,第Ⅱ大类第i小类中的PPO基因可能位于小麦2A和2D以外的染色体上,可作为改良面团色泽的侯选基因.通过对具有完整开放阅读框(ORF)的4条PPO基因比对后发现,位于小麦2D染色体长臂上的PPO基因(PPO-2D)存在丰富的等位变异,等位基因间有94个单核苷酸变异(SNP),其中发生在编码区的SNP(cSNP)有80个,这些cSNP中有36个影响到基因编码的氨基酸序列,属非同义cSNP.在非同义cSNP处,设计引物STS-H,对130个已连续测得两年PPO活性的小麦品种进行PCR扩增,结果发现STS-H在大部分低PPO活性品种中没有扩增出目标片段(a),而大部分高PPO活性品种可以扩增出460 bp的目标片段(b).方差分析表明,a、b两种类型品种的PPO活性均值差异达极显著水平(P＜0.01),说明非同义cSNP对小麦籽粒PPO活性有重要影响.与STS01引物(低PPO活性显性标记)比较后发现,STS-H与STS01是一对互补标记,根据STS01和STS-H引物各自的特点,研究了能同时扩增两对引物的多重PCR反应体系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	司红起	安徽农业大学农学院	63	570	13.0	20.0
2	马传喜	安徽农业大学农学院	112	1547	23.0	34.0
3	王晓波	安徽农业大学农学院	16	156	8.0	12.0
4	何贤芳	安徽农业大学农学院	5	38	3.0	5.0