棉纤维次生壁加厚期cDNA-AFLP表达谱剖析和转录组图谱构建

• 作者: 张桂寅 潘玉欣 王省芬 韩改英 马峙英 马骏
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 cDNA-AFLP 表达片段(TDFs) 转录组图谱 纤维发育
• 年，卷（期）: 2007,（12）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 1425-1429
• 页数: 5页
• 分类号: S5
• 字数: 4671字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074X.2007.12.012

摘要

棉纤维强度主要由棉纤维次生壁加厚期决定. 以陆地棉品种中棉所8号和海岛棉品种Pima90-53建立的包含109个单株的种间杂交F2群体为材料, 用cDNA-AFLP对棉纤维发育次生壁加厚期(20～25 DPA)基因表达谱进行剖析, 并构建了次生壁加厚期转录组图谱. 37对AFLP引物组合共检测到138个多态性表达片段(transcript-derived fragments, TDFs), 大小在100～722 bp之间, 其中75个TDFs (53.62%)在亲本和F2单株中均具有多态性. 在75个TDFs中, 37个和已发表的棉纤维EST同源性较高; 9个和已克隆的棉纤维基因, 如半胱氨酸蛋白激酶、液泡H+-焦磷酸激酶、液泡H+-ATP催化亚基、半乳糖蛋白、受体蛋白激酶、GIA/RGA-赤霉素应答元件和纤维素合成酶等的编码基因同源性高; 其他TDFs可能代表棉纤维发育过程中的新基因片段. 在75个TDFs中, 有46个集中分布在一个连锁群上.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马峙英	河北农业大学河北省作物种质资源重点实验室	124	2336	29.0	41.0
2	王省芬	河北农业大学河北省作物种质资源重点实验室	38	753	16.0	27.0
3	张桂寅	河北农业大学河北省作物种质资源重点实验室	32	713	15.0	26.0
4	潘玉欣	河北农业大学河北省作物种质资源重点实验室	3	42	3.0	3.0
5	马骏	河北农业大学河北省作物种质资源重点实验室	2	15	1.0	2.0
6	韩改英	河北农业大学河北省作物种质资源重点实验室	4	49	4.0	4.0