幽门螺杆菌napA基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 李妍 罗军 胡平 赖建平 龙北国 龙敏
• 来源期刊: 现代预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 幽门螺杆菌 NAP 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2007,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 820-822,825
• 页数: 4页
• 分类号: R378.99
• 字数: 3242字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-8507.2007.05.008

摘要

[目的]获取幽门螺杆菌NCTC 11639中性粒细胞激活蛋白基因(napA),预测其编码蛋白作为幽门螺杆菌疫苗候选抗原的可行性,为Hp疫苗研制奠定基础.[方法]提取幽门螺杆菌标准株NCTC 11639的基因组DNA,参照GeneBank中幽门螺杆菌标准株22695的序列设计引物PCR扩增napA基因,克隆入pMD18-T载体中,对重组质粒测序后进行生物信息学分析.[结果]克隆的napA基因全长为435 bp,在GenBank上登录(No.DQ341279),与GenBank公布的其它Hp菌株的核酸同源性为94%～98%,与国际测序模式株Hp26695、HpJ99同源性达97%.[结论]成功扩增Hp标准株NCTC 11639 napA基因,通过同源性检索分析表明Hp与人及其它哺乳动物的基因组DNA同源序列低,在不同Hp菌株中高度保守,符合疫苗候选抗原的基本特征;抗原表位预测显示有4条高抗原性肽段,其中118-140肽段抗原指数最强,可能存在良好的抗原表位,结合Hp-NAP二级结构、亲水性分析认为Hp-NAP是很有前景的幽门螺杆菌疫苗候选抗原.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李妍	南方医科大学生物技术学院热带病学教研室	47	170	6.0	10.0
2	龙敏	南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系	35	142	6.0	10.0
3	赖建平	广州大学化学化工学院食品科学系	25	140	7.0	9.0
4	罗军	南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系	29	96	6.0	8.0
5	胡平	南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系	4	15	2.0	3.0
6	龙北国	南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系	40	154	7.0	9.0