甘蓝型油菜半胱氨酸蛋白酶cDNA的克隆及组织特异性表达分析

• 作者: 张红岩 王茂林 薛华 赵云 马欣荣
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜 矮化突变体 半胱氨酸蛋白酶 相对定量PCR 衰老
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 172-176
• 页数: 5页
• 分类号: S6
• 字数: 4916字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1006-687X.2008.02.005

摘要

采用SSH (Suppression subtractive hybridization)和Race-PCR (Rapid-amplification of cDNA ends)技术克隆得到来自甘蓝型油菜(Brassica napus L.)矮化突变体'NDF-1'的一个差异表达基因编码区的全长cDNA序列,命名为Bncp5.该基因全长1 224 bp,含有1 080 bp的完整开放阅读框,编码359个氨基酸.该基因编码区与甘蓝中一个与衰老相关的半胱氨酸蛋白酶基因(登录号AF454960)同源性达97%,氨基酸序列同源性达到100%. Bncp5编码的蛋白相对分子质量为39.5×103,等电点为5.57.对其活性位点的分析表明其具备真核生物半胱氨酸蛋白酶的活性中心,且有很高的功能区段保守性,推测为一跨膜蛋白.相对定量PCR的检测结果表明, Bncp5在野生型和矮化突变体的根、茎、子叶和真叶中都有表达,但是表达量存在显著性差异.在野生型高秆油菜中,根的表达量最低,在真叶的表达量最高;在矮化突变体中,根、茎中的表达明显高于野生型,而在子叶和真叶中的表达量与野生型油菜的表达量基本一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马欣荣	中国科学院成都生物研究所	35	697	13.0	26.0
2	王茂林	四川大学生命科学学院	80	590	14.0	21.0
3	赵云	四川大学生命科学学院	77	751	14.0	24.0
4	张红岩	四川大学生命科学学院	3	31	3.0	3.0
5	薛华	四川大学生命科学学院	5	42	4.0	5.0