嗜盐古菌中氯视紫红质基因序列的遗传分析

• 作者: 吴敏 周祯 时晗 许学伟
• 来源期刊: 浙江大学学报（理学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 嗜盐古菌 氯视紫红质 细菌视紫红质 遗传分析 16S rDNA
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 80-86
• 页数: 7页
• 分类号: Q78|Q93
• 字数: 4400字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3785/j.issn.1008-9497.2008.01.019

摘要

采用PCR方法扩增了嗜盐古菌AB19、AB30和AJ5编码螺旋C至螺旋G的氯视紫红质(halorhodopsin,HR)蛋白基因片断和16S rRNA基因(16S rDNA),测定了它们的核苷酸序列,与已报道的hr基因序列差异显著.获得AJ5 HR蛋白基因序列在Halobiforma属中尚属首次.对hr基因序列进行的遗传分析,包括GC含量、转换与颠换的比值、密码子使用偏好,表明hr基因面临进化选择和偏倚突变压的双重制约,是一类进化程度较高的基因.对比br基因编码蛋白螺旋C到G的序列发现它们具有相似的种属特征.采用BR和HR蛋白螺旋C到G序列构建系统发生树比传统的16S rDNA序列具有优势,BR和HR可以作为两种新型的分子指标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴敏	浙江大学生命科学学院	86	737	15.0	24.0
2	许学伟	浙江大学生命科学学院	8	108	6.0	8.0
3	时晗	浙江大学生命科学学院	1	1	1.0	1.0
4	周祯	浙江大学生命科学学院	1	1	1.0	1.0