基于16S rRNA部分序列探讨12种鲹科鱼类的分子系统进化关系

• 作者: 朱世华 杨迎春 沈锡权 邹记兴 郑文娟
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鲹科 线粒体DNA 16S rRNA序列 系统发育
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 页码范围: 847-854
• 页数: 8页
• 分类号: S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2008.06.005

摘要

通过PCR扩增获得了中国海域的鲹科(Carangidae)8属9种的线粒体16S rRNA序列片段约598bp碱基,结合来自GenBank的3种鲹科鱼类的相应片段序列,并以大斑石鲈为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA version 3.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比和转换/颠换值等,应用最大简约法和邻接法构建系统树.结果显示:(1)鲹科鱼类的16S rRNA序列片段生成的序列矩阵中发现有碱基的插入和缺失,共有146bp变异位点,转换/颠换值为2.17,表明基因序列的突变未达到饱和,碱基平均差异为8.22%;(2)支持鲹科下设四个亚科(鲹亚科,亚科,鲳鲹亚科,鲹亚科)阶元的分类系统;(3)鲹亚科鲹属下不宜设亚属分类阶元;(4)及达副叶鲹与丽叶鲹亲缘关系近,16S rRNA序列片段碱基只有1.07%的差异,未达到分属水平.