4种海参16S rRNA和COI基因片段序列比较及系统学研究

• 作者: 李琪 李赟 陈丽梅
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 海参 16S rRNA基因 COI基因 序列比较 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 页码范围: 935-942
• 页数: 8页
• 分类号: Q959
• 字数: 4444字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2008.06.006

摘要

采用PCR技术对来自山东荣成、长岛、俄罗斯和日本的刺参(Apostichopus japonicus),来自澳大利亚的黄乳海参(Holothuria fuscogilva),来自冰岛的北大西洋瓜参(Cucumaria frondosa)和来自福建的二色桌片参(Mensamaria interce-dens)的16S rRNA和COI基因片段进行了扩增和测序,分别得到了长度约为500 bp和540 bp的片段.通过统计变异位点、平均核苷酸差异数和核苷酸多样性指数进行基因序列变异分析.结果表明,根据16S rRNA、COI基因片段进行刺参种内差异比较时,长岛和荣成刺参序列差异最小,和日本刺参序列差异最大;刺参和其他科3种海参种间的序列差异远远高于刺参种内差异.从GenBank中选取7条海参序列与本研究所测序列一同构建了NJ和ME系统树.根据2种基因片段的系统学分析均表明,刺参属和拟刺参属亲缘关系很近,可能有共同的起源.而海参科未与同属于楣手目(Aspidochirolida)的刺参科聚类,而与枝手目瓜参科和沙子鸡科聚为一支,与形态学的分类不一致.[中国水产科学,2008,15(6):935-942]

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李琪	中国海洋大学水产学院	152	1522	20.0	31.0
2	李赟	中国海洋大学水产学院	48	532	14.0	20.0
3	陈丽梅	中国海洋大学水产学院	4	148	4.0	4.0