麻疹疫苗株S-191全基因序列测定及与流行株进化关系的初步研究

• 作者: 于洁 张卿 张靖 李启明 王海龙 陈实 靳玉琴
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 麻疹病毒 RT-PCR 序列分析 Shanghai-191
• 年，卷（期）: 2008,（7）
• 所属期刊栏目: 疫苗学
• 页码范围: 624-628
• 页数: 5页
• 分类号: R3
• 字数: 4441字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0254-5101.2008.07.012

摘要

目的 对国内现在使用的Shanghai-191(S-191)疫苗株进行全基因组测序,针对国内已经分离出的毒株,分析它们与疫苗株的核酸序列差异以及流行特征.方法 利用RT-PCR的方法分段扩增S-191疫苗株的全基因并测序,从GenBank中获得全球24条麻疹全基因序列和211株中国各省分离到的麻疹流行株以及WHO各基因型参考株的N基因C端456个核苷酸序列,计算麻疹序列13个编码区和非编码区的突变率,分析病毒株和疫苗株基因型和遗传距离,构建基因亲缘性关系树.结果 获得S-191疫苗株的全基因序列并递交GenBank收录,进化树分析表明大部分流行株为H1基因型.各省流行株与S-191相比遗传距离为6.7%～8.2%.突变率分析显爪非编码区的突变率明显高于编码区,编码区中N基因的突变率最大.结论 本研究表明,中国大陆的麻疹病毒流行株以H1基因型为主,不存在明显的地域流行差异,在时间上也没有明显的突变积累特征.S-191疫苗株与近年来的麻疹流行株在遗传距离上差异较大,其保护作用需做进一步追踪探讨.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李启明	北京生物制品研究所基因工程研究室	17	79	4.0	8.0
2	张靖	北京生物制品研究所基因工程研究室	13	77	4.0	8.0
3	靳玉琴	北京生物制品研究所基因工程研究室	8	11	2.0	3.0
4	陈实	北京生物制品研究所基因工程研究室	7	16	3.0	4.0
5	于洁	北京生物制品研究所基因工程研究室	1	4	1.0	1.0
6	王海龙	北京生物制品研究所基因工程研究室	1	4	1.0	1.0
7	张卿	北京生物制品研究所基因工程研究室	1	4	1.0	1.0