砂梨扩展蛋白基因cDNA克隆及全序列分析

• 作者: 乔玉山 姚泉洪 宋长年 渠慎春 熊爱生 章镇 胡钟东
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 砂梨 扩展蛋白 分子克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 166-171
• 页数: 6页
• 分类号: S665.1
• 字数: 4853字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-9980.2008.02.005

摘要

设计植物EXP扩展蛋白简并引物,以砂梨果实cDNA为模板.克隆得到EXP基因cDNA片段.该片段长465 bp.根据该片段序列,分别设计2条5'和3'末端扩增的特异引物,利用RACE技术,获得了该片段的5'端和3'端序列.用DNAMAN5.22软件对3个序列进行拼接和分析,获得了该基因的cDNA全长,命名为Pyp-EXP.该cDNA全长为1 395 bp,5'端起始密码子ATG始于72 bp,3'端终止子TAG止于830 bp,Ploy+(A)从1 363～1 395 bp.该基因已在GenBank基因数据库注册,注册号为EF602031.Pyp-EXP核苷酸序列有一个759 bp完整的开放阅读框,编码区与西洋梨、苹果、湖北海棠、桃的同源性分别为96%,96%,94%和86%;该cDNA推导编码252个氨基酸,含有1个组氨酸(His_Phe_Asp,HFD)功能域,与西洋梨、苹果、湖北海棠、桃中相应序列同源性分别为98%,97%,95%和93%.该基因的克隆为研究扩展蛋白的时空表达及其在果实发育和成熟过程中的作用奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	章镇	南京农业大学园艺学院果树生物技术研究室	286	5756	35.0	58.0
2	宋长年	南京农业大学园艺学院果树生物技术研究室	40	502	16.0	21.0
3	乔玉山	南京农业大学园艺学院果树生物技术研究室	82	1302	22.0	33.0
4	渠慎春	南京农业大学园艺学院果树生物技术研究室	98	858	17.0	25.0
5	姚泉洪	上海市农业科学院生物技术研究所	62	1232	19.0	33.0
6	熊爱生	上海市农业科学院生物技术研究所	32	471	13.0	20.0
7	胡钟东	南京农业大学园艺学院果树生物技术研究室	6	54	4.0	6.0