Pseudomonas stutzeri A1501基因组结构及功能注释

• 作者: 平淑珍 杨剑 林敏 燕永亮 王忆平 窦岳坦 金奇
• 来源期刊: 中国农业科技导报
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因组测序 斯氏假单胞菌A1501 联合固氮 比较基因组学
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 所属期刊栏目: 专栏:863课题研究进展
• 页码范围: 45-52
• 页数: 8页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 7555字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0864.2008.05.010

摘要

采用全基因组"shotgun"方法完成了固氮斯氏假单胞菌A1501的全基因组序列测定,并进行了基因组结构与功能注释分析.A1501基因组伞长4 567 418 bp,含有4 146个ORFs.该基因组中已鉴定了42个编码转座酶的重复序列,这些序列的存在预示着转座现象在A1501菌中非常活跃,预示该菌与其他生物之间基因交流可能比较频繁.比较基因组表明,为了适应特定的生存环境,假单胞菌在基因组结构和遗传信息容量上产生了明显的分化.此外,基因组分析鉴定了A1501环境适应的遗传基础,包括物质转运、信号传导和趋化系统等,这些系统是细菌能够在根际土壤环境中保持竞争力以及能够与水稻形成高效联合固氮体系的关键.A1501基因组的完成为进一步开展功能基因组学和蛋白质组学研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林敏	中国农业科学院生物技术研究所	68	905	15.0	28.0
2	燕永亮	中国农业科学院生物技术研究所	22	109	5.0	10.0
3	平淑珍	中国农业科学院生物技术研究所	29	382	8.0	19.0
4	金奇		19	225	7.0	14.0
5	王忆平	北京大学生命科学学院	11	84	5.0	9.0
6	窦岳坦	中国农业科学院生物技术研究所	5	152	4.0	5.0
7	杨剑		3	18	3.0	3.0