鸭瘟病毒gC基因的克隆及其分子特性分析

• 作者: 信洪一 徐超 朱德康 李欣然 汪铭书 程安春 练蓓 罗启慧 贾仁勇 陈孝跃
• 来源期刊: 中国兽医科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭瘟病毒 gC基因 克隆 分子特性
• 年，卷（期）: 2008,（12）
• 所属期刊栏目: 病原生物学
• 页码范围: 1038-1044
• 页数: 7页
• 分类号: S852.659.1:Q786
• 字数: 5832字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4696.2008.12.005

摘要

对已构建的鸭瘟病毒(DPV)DNA文库重组质粒测序后,运用ORF Finder、BLASTN等工具进行全面生物信息学分析,根据分析结果设计引物,以DPV DNA为模板进行PCR扩增和T克隆,获得完整基因,经测序和探针核酸斑点杂交进行验证.结果证实,获得的完整ORF片段(ORF1296)为DPV的gC基因(GenBank登录号EU076811),全长1 296 bp,与已报道的其他疱疹病毒gC基因具有较高的同源性,它编码432个氨基酸,蛋白分子质量为45 ku、等电点(PI)为5.292,具有疱疹病毒典型Ⅰ型膜蛋白结构特征.gC基因进化树分析表明,DPV与α-疱疹病毒亚科的鸟源疱疹病毒亲缘关系最近,编码的gC蛋白多为柔性区域,富含无规卷曲,含少量α-螺旋和β-折叠,氨基酸序列的第21～24、50～58、67～70、161～171、273～281、387～393位最有可能为抗原表位.此结果为进一步开展DPV gC基因及其编码蛋白的深入研究提供了有用数据.