甘草根cDNA文库构建与分析

• 作者: 刘春生 张卉 杨全 王文全 魏胜利
• 来源期刊: 中国中药杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 甘草 cDNA文库 EST
• 年，卷（期）: 2008,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1386-1389
• 页数: 4页
• 分类号: Q78
• 字数: 3331字
• 语种: 中文

摘要

目的:构建甘草cDNA文库,为甘草功能基因的研究以及筛选、克隆与甘草次生代谢产物合成途径相关基因奠定基础.方法:以LiCl沉淀法提取根组织总RNA,置换合成法合成双链cDNA,末端补平,连接EcoR I并磷酸化,以pBlueScriptⅡ为载体并电转化感受态细胞E.coli DH10β,测定文库的克隆数、重组率,PCR测定插入片断大小.同时,对文库进行随机测序并在GenBank中进行同源性检索和功能预测.结果:经鉴定文库的库容量为1.15×107,重组率为98.2%,插入片段在0.5～4.8 kb,平均片段长度大于1.0 kb;经随机测序,获得126条EST,BLAST分析表明,大多数EST与豆科植物以及拟南芥、水稻等植物基因序列具有较高的同源性,在86条已知功能基因中,主要为细胞代谢、抗逆性、生长抑制及休眠相关的基因,其余40条EST为未知功能基因.结论:构建的甘草根cDNA文库库容量大、重组率高且插入的cDNA片段较长,能够满足甘草功能基因的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨全	广东药学院中药学院	58	816	17.0	26.0
2	王文全	北京中医药大学中药学院	231	4333	32.0	52.0
3	魏胜利	北京中医药大学中药学院	56	1125	13.0	33.0
4	刘春生	北京中医药大学中药学院	159	1169	18.0	27.0
5	张卉	北京中医药大学中药学院	8	139	6.0	8.0